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En vertu des accords d'Arusha, signés entre les deux belligérants en août 1993, la composition de la nouvelle armée rwandaise devait respecter un équilibre entre «rebelles» et gouvernementaux. Si la troupe devait être composée à 40% d'ex-maquisards de l'Armée patriotique rwandaise et à 60% de soldats gouvernementaux, on devait retrouver dans son commandement une répartition égale des deux parties.
Depuis la victoire militaire du Front patriotique rwandais, en juillet 1994, les nouvelles autorités de Kigali tentent de faire respecter ces accords en intégrant les vaincus d'hier dans l'armée nationale. Pour l'heure, seuls 2 000 des 30 000 soldats estimés de l'ancienne armée régulière ont décidé de franchir le pas et les autorités de Kigali affirment vouloir garder ouvertes le plus longtemps possible les portes des camps de «réorganisation».